Python3 install from source code
๐ Python page ๐ Python 3.12.0 Donwload page openssl v.1.1.1 ์ด์ wget https://www.python.org/ftp/python/3.12.0/Python-3.12.0.tgz tar -xvzf Python-3.12.0.tgz cd Python-3.12.0 ./config...
๐ Python page ๐ Python 3.12.0 Donwload page openssl v.1.1.1 ์ด์ wget https://www.python.org/ftp/python/3.12.0/Python-3.12.0.tgz tar -xvzf Python-3.12.0.tgz cd Python-3.12.0 ./config...
22๋ ์ ์ฐ ์ค๋๋น io9์ด ์ ์ ๋ง์ด ๊ฐ๊ณ ์๋ค. ๋ฏธ๊ตญ์์ ๋์ง์ด๋ฆผ์ 6๊ฐ์๊ฐ ํ๋ฉด์ ์ฌ์ฉ๋์ด ์ ์ด์ง๊ณ ๋ง๊ฒ๋ ๋ช์ฃผ๋์ ๋ฐฉ์ ์ํจ์ฑ๋ก ์์ฐ๋ค๋ณด๋๊น ๋ฐฐํฐ๋ฆฌ์๋ช ์ด ๊ฐ์ จ๋๋ณด๋๋ผ ๋ฉฐ์น ์์จ๋ ๋ฐฐํฐ๋ฆฌ๊ฐ ๊ธ๋ฐฉ ๋ณ๊ณ , ์ถฉ์ ์๊ฐ๋ ์์ ๋ณด๋ค ํจ์ฌ ๊ธธ์ด์ ธ์ ํ๋ฃจ์ข ์ผ ์คํ ์ด์ ์ ์ฌ๋ ค๋ฌ์ผํ๋ ์ ๋๊ฐ ๋ผ์ ๋ถํธํจ์ ๋๋ผ๊ธฐ ์์ํ๋ค. ์๋ก ์ด๊น ํ๋ค๊ฐ ๋ฏธ๊ตญ์ธ์ฒ๋ผ ๊ณ ์ณ๋ณด...
์ง๋๋ฒ ํฌ์คํ ์์๋ DoubletFinder๋ก Doublet์ฐพ๋ ๋ฐฉ๋ฒ์ ์์๋ดค๋๋ฐ.. Doublet์ด ๋ญ์ง, DoubletFinder ์ฌ์ฉ๋ฒ ๐ [QC] DoubletFinder: doublet ์ ๊ฑฐ๋ฒ 01 ํฌ์คํธ ์ฐธ์กฐ ์ด๋ฒ์๋ ๋น์ทํ์ง๋ง ๋ค๋ฅธํด,Scrublet,๋ก ๋๊ฐ์ด Doublet์ ์ฐพ์๋ณด๊ณ DoubletFinder๊ฒฐ๊ณผ๋ ๋น๊ตํด๋ณด...
์ค๋์!! ํ๋ฆฌ ๋์ ํธ ๋ง์ง ์๊ฐํธ! ์์ด์คํฌ๋ฆผ ๋ง์ง! โ๏ธFrozenโ๏ธ ํ๊ตญ์ ์ฒ ํ์์ด์คํฌ๋ฆผ ์ ํ์ด ์ง๋์ง ํ์ฐธ๋๊ฒ ๊ฐ์๋ฐ ์ฌ์ค ๋๋ ์ ํ๋ธ์์ ์ฅ๋์น๋๊ฒ๋ง ๋ดค์ง ์ค์ ๋ก ๊ฐ๊ฒ์์ ํ๋๊ฑด ๋ณธ์ ์ด ์์. ์ฝ๋์คํค ์ ์ธ ํ๋ฆฌ์๋ ์ฒ ํ์์ด์คํฌ๋ฆผ ๊ฐ๊ฒ๋ค์ด ๊ฝค์๋ค. ๋ช๊ตฐ๋ฐ ๊ฐ๋ดค๋๋ฐ ์ฒ ํ์์ด์คํฌ๋ฆผ์ ์ด์ง์ด ์ ์ผ ๋ง์๋๋ฏ๐ง๐ง Frozen - Rolle...
๋ฏธ๊ตญ์ ์จ์ง 6๊ฐ์์ฏค๋๋ ์ข ๋ ํํ์ด ์๋ ์นด๋๊ฐ ์ฐ๊ณ ์ถ์ด์ก๋ค. ๊ทธ ์ ๋ถํฐ ์๋ง์กดํ๋ผ์, ์คํ์ด์ด ๋ญ์๊นฝ ๋ฑ๋ฑ ์ฌ๋ฌ๊ตฐ๋ฐ๋ฅผ ๋๋๋ ค๋ดค์ง๋ง ์์ง ์ ์ฉ์ด ์๊ธด ๊ธฐ๊ฐ์ด ์งง๋ค๋ ์ด์ ๋ก ์๊พธ ๋น ๊พธ๋ฅผ ๋จน์๋ค. ์ด๋ฐ ์คํจ๊ฐ ์์ด๋ฉด ์ ์ฉ์ ์๊ฐ ๋ ๋จ์ด์ง๋ค ์กฐ์ฌํ์ ๋ด๋ ์ ํ๊ตญ์ ์ ๊น ๋ค์ด๊ฐ๋ค์ฌ ๊ณํ์ด ์กํ ๋ค๋ถํฐ๋ ๊ฐ๋ ฅํ๊ฒ ๋ํํญ๊ณต ๋ง์ผ๋ฆฌ์ง๋ง ๋ฐ๋ก ์์ด๋ ๐...
๋ด์ ์ฌ์๋ ๋ถ ์ค, ์์ ๊ทธ๋ฆผ ๊ฐ์ ํํฌ ํธ๋ญ์ ๋ณด์ ๋ถ์ด ์์๊น์? ๋ญ ์์ ๊ณผ์ ์ด ๋ง์๋๋ฐ ์ค๋์ ์ธ์คํ์์ ๋ฏธ์น๋ฏ์ด ๊ด๊ณ ๋ฅผ ๋๋ฆฌ๋ Piece of cake(ํผ์ค์ค๋ธ์ผ์ดํฌ)๋ก ์ด์ฌํ ํ๊ธฐ๋ฅผ ๊ณต์ ํด๋ณผ๊นํจ. ๐จ๐จ๐จ ๋ด์์์ ์ถ์ด ๋์์ง ์์์ง๋ง ํ๋ฆฌ๋ก ์ด์ฌ๊ฐ๊ธฐ๋ก ๊ฒฐ์ ํ๊ณ ์ง๊ณ์ฝ๊ณผ ๋์์ ์ฌ๋ฌ๊ฐ์ง ์ด์ฌ ๋ฐฉ๋ฒ์ ๋ณด๊ธฐ ์์ํ๋๋ฐ.. ๋ณดํต ๋ฏธ๊ตญ ์ฌ...
์๋ฒ์์ ๋ด conda env ์ฌ์ฉํด์ jupyter notebook์ฐ๊ณ ์ถ์๋ฐ ๋ด ํ๊ฒฝ์๋ jupyter๊ฐ ์ค์น๊ฐ ์๋ผ์๋น ์ ฑ์ ์ค์นํด ์ค์นํด ์งํ์์ผ ๐ Anaconda jupyter page ํ๊ฒฝ ๋จผ์ activate ์์ผ์ฃผ๊ณ ์์ ๐ Anaconda ๊น๊ณ env ๋ง๋๋๋ฒ ํฌ์คํธ conda install -c conda-forge...
์์ฆ ๊ณ์ ๊ธฐ๋ณธ ํด์ ๋ค์ ์ค์นํ๋ ์๊ฐ์ด ์๊พธ ๋์์ค๋๋ฐใ ใ ใ ์ค๋์ CMake! ๊ฐ๋ณด์๊ตฌ! ๐ Cmake download page wget https://github.com/Kitware/CMake/releases/download/v3.27.6/cmake-3.27.6.tar.gz tar cmake-3.27.6.tar.gz cd cmake...
Seurat Version 5๊ฐ ๋์จ์ง๋ ๋ฐ๋ ์ด ๋ผ๊ฐ๋๊ฑฐ ๊ฐ์๋ฐ ์์ง๋ ๊ณผ๋๊ธฐ๋๋์ด ๋๋ ๋ฒ๊ทธ๋ competible issue๊ฐ ๊ณ์ ๋ณด์ธ๋ค. ์์ง๊น์ง ๋ค๋ฅธ tool๋ค์ด seurat verion 5๋ฅผ ์ง์ํ๊ณ ์์ง ์๊ธฐ ๋๋ฌธ์ (๋ ์ธ์ ๋ฑ ๋ง๊ฒ ์ ๋์๊ฐ๋ ํด์ ์ฐพ์๊นใ ใ Seurat 3์ ๋๋ 2๋ฐ์ ์ง์์ํด์ ๋น์ทํ struggling์ ๊ฒช๊ณ ใ ...
ํํ ์ด๋๋ ๊ฐ์๊ธฐ ๋ฐ๋ฐ๋ฅ๋ถํฐ ๋ค์ ์์ํ๋ผ๊ณ ํ๋ฉด ์ด๋ฐ ๊ธฐ๋ถ์ผ๊น. ์ด์จ๋ ๋ gcc๋ถํฐ ์ค์นํ๋ ๋ถ์์ฌ๊ฐ ๋์๊ฒ ์ฐพ์์๋ค. ์ค๋๋ ํ๋ด๋ณด์. ํ๋ฒ ํ ๋ ์ํ์. ๐ GCC homepage wget https://ftp.gnu.org/gnu/gcc/gcc-13.2.0/gcc-13.2.0.tar.gz tar gcc-13.2.0.tar...