📑 Borcherding, Nicholas, Nicholas L. Bormann, and Gloria Kraus. “scRepertoire: An R-based toolkit for single-cell immune receptor analysis.” F1000Research 9 (2020). 🔗 Bioconductor page 🔗 ...

📑 Wang, Xuran, et al. “Bulk tissue cell type deconvolution with multi-subject single-cell expression reference.” Nature communications 10.1 (2019): 380. 🔗 Github page 🔗 v.1.0.0 Tutorial ...

📑 Newman, Aaron M., et al. “Determining cell type abundance and expression from bulk tissues with digital cytometry.” Nature biotechnology 37.7 (2019): 773-782. 🔗 Github page 🔗 v.1.0.0 Tu...

하루는 프로그램 돌리고 나온 리스트형 결과를 다시 모아서 그림을 그리려고 melt()함수를 사용했는데 자꾸 warning이 뜨더라.. > m.prop = rbind(melt(Est.prop$Est.prop.weighted), melt(Est.prop$Est.prop.allgene)) Warning messages: 1: In type.conve...

ml gdal/3.5.2 ml proj/8.1.0 Installation SQLite3 🔗 Download page wget https://www.sqlite.org/2023/sqlite-autoconf-3430200.tar.gz tar -xvzf sqlite-autoconf-3430200.tar.gz cd sqlite-autoconf-...

🔗 Python page 🔗 Python 3.12.0 Donwload page openssl v.1.1.1 이상 wget https://www.python.org/ftp/python/3.12.0/Python-3.12.0.tgz tar -xvzf Python-3.12.0.tgz cd Python-3.12.0 ./config...

22년에 산 오랄비 io9이 점점 맛이 가고 있다. 미국에서 두집살림을 6개월간 하면서 사용량이 적어지고 많게는 몇주동안 방전시킨채로 안쓰다보니까 배터리수명이 가셨나보더라 며칠 안써도 배터리가 금방 닳고, 충전시간도 예전보다 훨씬 길어져서 하루종일 스테이션에 올려둬야하는 정도가 돼서 불편함을 느끼기 시작했다. 새로 살까 하다가 미국인처럼 고쳐보...

지난번 포스팅에서는 DoubletFinder로 Doublet찾는 방법을 알아봤는데.. Doublet이 뭔지, DoubletFinder 사용법 👉 [QC] DoubletFinder: doublet 제거법 01 포스트 참조 이번에는 비슷하지만 다른툴,Scrublet,로 똑같이 Doublet을 찾아보고 DoubletFinder결과랑 비교해보...

오늘은!! 필리 디저트 맛집 소개편! 아이스크림 맛집! ❄️Frozen❄️ 한국은 철판아이스크림 유행이 지난지 한참된것 같은데 사실 나도 유튜브에서 장난치는것만 봤지 실제로 가게에서 파는건 본적이 없음. 콜드스톤 제외 필리에는 철판아이스크림 가게들이 꽤있다. 몇군데 가봤는데 철판아이스크림은 이집이 제일 맛있는듯🍧🍧 Frozen - Rolle...

미국에 온지 6개월쯤되니 좀 더 혜택이 있는 카드가 쓰고 싶어졌다. 그 전부터 아마존프라임, 샤파이어 뭐시깽 등등 여러군데를 두드려봤지만 아직 신용이 생긴 기간이 짧다는 이유로 자꾸 빠꾸를 먹었다. 이런 실패가 쌓이면 신용점수가 더 떨어진다 조심하자 내년에 한국에 잠깐 들어갔다올 계획이 잡힌 뒤부터는 강력하게 대한항공 마일리지마 바로 쌓이는 🌈...