Seurat 4 error 대처법: 초심으로 돌아가 지우고 다시 깔아라
원래 잘돌아가던 코드가 하루아침에 갑자기 처음보는 에러를 내며 앞으로 나아가질 못하게 만들었다. subset, FindNeighborhood, Normalization등 스텝도 다양하게 바꿔가며.. 사람을 미치게 만듬. 해결방법 결론부터 말하면 다 지우고 다시깔면 해결된다. remove.packages("Seurat") #이렇게 하면 지울 수 있...
원래 잘돌아가던 코드가 하루아침에 갑자기 처음보는 에러를 내며 앞으로 나아가질 못하게 만들었다. subset, FindNeighborhood, Normalization등 스텝도 다양하게 바꿔가며.. 사람을 미치게 만듬. 해결방법 결론부터 말하면 다 지우고 다시깔면 해결된다. remove.packages("Seurat") #이렇게 하면 지울 수 있...
Seurat4 conda create -n Seurat4 conda activate Seurat4 conda search r-base conda install -c conda-forge r-base=4.3.2 conda install -c conda-forge r-devtools # in R # .libPaths() if (!require("Bi...
시작은 구글 서치 콘솔이었다.. 아무리 기다리고 정리해도 새로운 포스트들의 색인 생성이 진행이 안되는것! 이유인즉.. 크롤링하려고 했으나 사이트가 과부하될 수 있어서 스케줄을 조금 미뤘다는데 너무 미루는거 아니냐? 싶지만 나는 나대로 과부하 될만한 요소를 없애주기로 했다 사이트가 과부하될 수 있는 요소는 아무래도 텍스트보다는 이미지와 동영상...
이 글은 제가 초안을 작성하고 chatGPT에 의해 수정되었습니다 반년 넘게 vision insurance에 가입했지만, 혜택을 한 번도 이용하지 않았어요. 갱신 기간이 다가오면서, 이번에는 혜택을 사용해보기로 했습니다. 한국에서는 안경과 렌즈를 쟁여왔기 때문에 필요는 없었지만, 앞으로 한국에 가지 못할 것을 고려해 미국에서 정기 검진을 받고 구매 ...
📑 Borcherding, Nicholas, Nicholas L. Bormann, and Gloria Kraus. “scRepertoire: An R-based toolkit for single-cell immune receptor analysis.” F1000Research 9 (2020). 🔗 Bioconductor page 🔗 ...
📑 Wang, Xuran, et al. “Bulk tissue cell type deconvolution with multi-subject single-cell expression reference.” Nature communications 10.1 (2019): 380. 🔗 Github page 🔗 v.1.0.0 Tutorial ...
📑 Newman, Aaron M., et al. “Determining cell type abundance and expression from bulk tissues with digital cytometry.” Nature biotechnology 37.7 (2019): 773-782. 🔗 Github page 🔗 v.1.0.0 Tu...
하루는 프로그램 돌리고 나온 리스트형 결과를 다시 모아서 그림을 그리려고 melt()함수를 사용했는데 자꾸 warning이 뜨더라.. > m.prop = rbind(melt(Est.prop$Est.prop.weighted), melt(Est.prop$Est.prop.allgene)) Warning messages: 1: In type.conve...
ml gdal/3.5.2 ml proj/8.1.0 Installation SQLite3 🔗 Download page wget https://www.sqlite.org/2023/sqlite-autoconf-3430200.tar.gz tar -xvzf sqlite-autoconf-3430200.tar.gz cd sqlite-autoconf-...