R memory 관리: limit 확인하고 maximum 재설정하기
single-cell data를 R로 처리하다보면 가끔 작업중에 core dump나 killed, cannot allocate vector 등의 메모리 에러가 난채로 죽기도 하는데 난 보통 5만개 이상의 cell을 처리할때는 50기가 이상을 잡고 시작한다. 여러개의 file을 integrated analysis해야한다면 더 많은 메모리를 필요로 한다...
single-cell data를 R로 처리하다보면 가끔 작업중에 core dump나 killed, cannot allocate vector 등의 메모리 에러가 난채로 죽기도 하는데 난 보통 5만개 이상의 cell을 처리할때는 50기가 이상을 잡고 시작한다. 여러개의 file을 integrated analysis해야한다면 더 많은 메모리를 필요로 한다...
이전에 서버 접속하고 서버파일 시스템을 mac finder에 연동하는 커맨드를 알아봤는데, 코드가 길어서 매번 입력하기 귀찮. 별명(alias)을 만들어서 짧은 명령어로 같은 결과를 얻을 수 있게 해보자. 원래 파일연동 커맨드를 다음과 같았다. sshfs subin@minerva.mssm:/storage/work/subin /Users/SC/MS...
bash에서 파일 읽어들여서 디렉토리 만들기 for name in $(cat SRA_SRP_list.txt) do if [ ! -d ${name} ]; then mkdir ${name} fi done 파일 한줄씩 읽기 # for for name in $(cat names) do echo "UserName: "${name} do...
서버에서 파일을 다운로드/업로드 하는데에는 여러가지 방법이 있을 수 있다. 쉽게는 CyberDuck이나 filezila같은 어플리케이션을 사용할 수도 있고, window OS의 mobaXterm같은 SSH client 프로그램에서는 파일 트렌스퍼까지 도와주고 있으니 이런 것들을 활용하면 좋겠다. 이 외에도 따로 프로그램을 깔지 않고> Mac F...
그냥 FeaturePlot() 을 그리면 나오는 제목이 너무 작아서 ppt에 넣으려면 그림 윗부분을 자르고 다시 gene 이름을 써넣는등 두번 세번식 일해야하는게 귀찮아서 제목 사이즈 키우는 법을 검색해봤다. Default FeaturePlot으로 그렸을때 FeaturePlot(NSC.edited, c("SOX2","CDH2"), cols=c("g...
깃허브에서 페이지 기능을 이용해서 블로그를 만들었고 + 이제 구글에서 검색 가능하게 하려고 서치콘솔에까지 연결했는데, sitemap.xml 재제출 (상태 성공, 페이지 수도 맞음) feed 재제출 수정하고 2주~4주 기다림 페이지 하나씩 색인생청요청함 위같이 별짓을 다해도 색인생성이 제대로 되지 않는다면.. 깃험 username...
깃헙을 처음 만들고.. _config.yml 파일에 본인 블로그의 기본 정보를 잘 넣었다면 이론상 userID.github.io에 접속했을 때 자신이 고른 jekyll 테마의 홈페이지가 나와야한다. 근데 상상했던 것과는 다르게 404 페이지가 나온다면?! Github pages not deploying #628 문제 확인 먼저 깃 블로그를 만...
난이도: ⭐️ ⏳: 1hr 💸: ~$7 준비물 (2인분) 식용유 1 밥숟가락 150g (돼지)고기 ($2) 양파 1개 ($0.4) 당근 1/4개 ($0.25) 간장 1 밥숟가락 케찹 1 밥숟가락 물 500ml 카레 가루 100g (고형 카레 2조각) ($2) 버터 (맨 마지막에 올려 먹는 용) 밥 ...
미국에 갔다면 가장 먼저해야 할 일은 “미국 번호를 만드는 일”이다. 집구하기에 비하면 굉장히 간단하니 도착하는 당일 하는것을 추천. 신청하기 전에.. 만약 Spectrum에서 인터넷을 구독할 생각이 있다면 인터넷 설치 먼저 하고 오는 걸 추천!! Spectrum에서 인터넷 신청하면 12개월동안 핸드폰 무제한 요금제 1개 라인을 공짜로 ...
메일 아래에 서명을 넣으면 따로 이야기하지 않아도 수신자가 내 직함과 연락처, 주소를 알기 쉽다. +looks fancy✨ Gmail 설정 gmail 기본 화면(inbox) > 오른쪽 상단 Settings(톱니바퀴) > See all settings 설정 들어가서 General 탭에서 아래로 스크...