뉴욕에서 non-driver license받은지 얼마나 됐다고ㅋㅋㅋ 아이디 콜렉터가 되겠어!! 뉴욕에서는 불가능했지만, 필라델피아는 한국에서 발급받은 국제운전면허증을 필리 운전면허증으로 바꾸는게 가능하다. non-driver license 아니고 실제로 운전가능한 운전면허로 발급가능 운전면허없이 운전할 일이 생기면, '허엉 오빠 미안 내가 여기 ...

Installation BiocManager::install(c("AUCell", "RcisTarget")) BiocManager::install(c("GENIE3")) # Optional. Can be replaced by GRNBoost ## Optional (but highly recommended): # To score the network...

논문 정보 Aibar, Sara, et al. “SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering.” Nature methods 14.11 (2017): 1083-1086. Installation 투 스텝으로 나눠지는데 Running SCENIC (VSN: inclu...

👉 R version 4 homepage TL;DR wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.3.1.tar.gz tar -xvzf R-4.3.1.tar.gz cd R-4.3.1 mkdir /source/R-4.3.1 ./configure --prefix=source/R-4.3.1 make...

gitpage로 블로그 쓰려고 하니까 가끔 지도를 넣을 수 있으면 좋겠다는 생각이 들어서 찾아봤다. 방법이 의외로 간단. TL;DR 구글지도 위치에서 ‘share(공유)’ > ‘지도퍼가기’ > ‘HTML 복사’ 그대로 markdown에 갖다붙이면 끝! 구글지도에 가서 공유하고 싶은 위치 검색 > ‘공유’...

오랜만에 오빠랑 외식하러 나왔다! 연구실의 친구한테 추천받은 동네 분위기 맛집에 가기로 함 !!! 예약필수 !!! 구글지도에서 바로 예약할 수 있다 들어가면 바로앞에 테라스?온실? 느낌의 브런치 테이블자리가 있고 출처:GoogleMap1 중문을 넘어서 더 안쪽으로 들어가면 어둡지만 펍 분위기를 풍기는 큰 테이블의 식사자리가 있다 ...

Dead cell removal이 필요한 이유 single-cell sequencing은 단일 세포 단위로 유전체, 전사체, 또는 단백체를 분석할 수 있다. 이 방법을 사용하면 조직이나 세포집합 내에서의 세포간 차이를 정밀하게 파악할 수 있다. 하지만, 이 방법의 정확성과 효율성을 유지하기 위해서는 good quality의 cell/sample을 얻...

Doublet이란? Doublet은 두 개의 세포가 하나의 단일 세포로 인식돼서 분석할때 생기는 문제를 일컷는다. 이는 10X와 같이 droplet-based sequencing과정에서 주로 발생하는데.. 기계가 자동으로 cell suspension에서 단일 세포와 barcode정보를 담고 있는 bead를 하나씩 하나의 droplet에 담는 과정에서...

box plot 지난번에는 찾은 cell type의 비율을 bar plot, pie char로 정리하는 코드를 작성했었는데 👉 cell type proportion barplot으로 표현하기 포스트 👉 cell type proportion pie chart로 표현하기 포스트 이번에는 cluster별로, condition별로 cell ...

Pie chart 지난번에는 찾은 cell type의 비율을 bar plot으로 정리하는 코드를 작성했었는데 👉 cell type proportion barplot으로 표현하기 포스트 이번에는 pie chart로 정리해보자. 예시 데이터 같은 데이터 level1(coarse)과 level2(fine) 두 단계로 나눠서 cell ty...