mac 기본 terminal에서 기본설정으로 zsh를 사용하고 있는데, 정규표현식 *이 안먹어서 찾아보고 정리함 안먹는 예시 scp -P 1234 subin@234.234.234:/path/location/*.png ./ 서버의 폴더 안에 있는 모든 그림을 다운받고 싶은데 * 전체를 의미하는 정규표현식 안먹음 해결방법 scp -P 1234 su...

📆 Published on 2022 Oct 27 🎓 Authors Justin Lakkis et al. 🏫 Affiliation University of Pennsylvania 🔗 link Natu...

Post doc house 계약하려고 하니 보증금과 첫달 월세를 내야했는데,.. 현금 / 신용카드 / 체크카드 다 안된다니!! 미국 선진국이라며.. 이게 뭐람. 말도 안돼.. 심지어 계좌이체도 안된단다. 후후 은행에 가서 “수표 Check”를 만들어야한다. Money order 란.. 우리나라에서 수표는 한종류지만 미국에서는 다양한 종류의 ...

집계약을 했다면, 들어가기 전에 전기 / 수도 / 난방 같은 문제를 해결해야한다. 자본주의의 나라답게 모든게 민영화 돼있기 때문에 다양한 utility 회사중에 맘에 드는 회사를 골라서 신청하면된다. 보통 housing manager가 그 건물은 어떤 회사를 많이 쓰는지 알려주는듯 함. 나는 ConEdison이라는 회사에 연락하라는 안내를 받아서 ...

single-cell data를 다루다 보면 gene name이라던지, cell ID에 원치않는 부가정보가 붙어서 따라올때가 있는데 이를 정리해주고 싶다면 rstrsplit function을 사용해아한다. cell ID (ABCDABCDABCDABCD-1)에서 “-1” 부분을 지우고 싶다. ADT file 읽어들였는데 feature name...

single-cell data를 R로 처리하다보면 가끔 작업중에 core dump나 killed, cannot allocate vector 등의 메모리 에러가 난채로 죽기도 하는데 난 보통 5만개 이상의 cell을 처리할때는 50기가 이상을 잡고 시작한다. 여러개의 file을 integrated analysis해야한다면 더 많은 메모리를 필요로 한다...

이전에 서버 접속하고 서버파일 시스템을 mac finder에 연동하는 커맨드를 알아봤는데, 코드가 길어서 매번 입력하기 귀찮. 별명(alias)을 만들어서 짧은 명령어로 같은 결과를 얻을 수 있게 해보자. 원래 파일연동 커맨드를 다음과 같았다. sshfs subin@minerva.mssm:/storage/work/subin /Users/SC/MS...

bash에서 파일 읽어들여서 디렉토리 만들기 for name in $(cat SRA_SRP_list.txt) do if [ ! -d ${name} ]; then mkdir ${name} fi done 파일 한줄씩 읽기 # for for name in $(cat names) do echo "UserName: "${name} do...

서버에서 파일을 다운로드/업로드 하는데에는 여러가지 방법이 있을 수 있다. 쉽게는 CyberDuck이나 filezila같은 어플리케이션을 사용할 수도 있고, window OS의 mobaXterm같은 SSH client 프로그램에서는 파일 트렌스퍼까지 도와주고 있으니 이런 것들을 활용하면 좋겠다. 이 외에도 따로 프로그램을 깔지 않고> Mac F...

그냥 FeaturePlot() 을 그리면 나오는 제목이 너무 작아서 ppt에 넣으려면 그림 윗부분을 자르고 다시 gene 이름을 써넣는등 두번 세번식 일해야하는게 귀찮아서 제목 사이즈 키우는 법을 검색해봤다. Default FeaturePlot으로 그렸을때 FeaturePlot(NSC.edited, c("SOX2","CDH2"), cols=c("g...