[10X CellRanger] 커스텀 레퍼런스 만들기
CellRanger에서는 대중적으로 많이 쓰이는 (GRCh38, mm10같은..)reference는 다운받아서 바로 사용할 수 있게 미리 만들어 제공하고 있다.1 다른 종이나 제공하지 않는 버전의 reference를 사용해서 분석하고 싶다면 custom reference를 만들어서 cellranger pipeline에 먹이면 되는데, referenc...
CellRanger에서는 대중적으로 많이 쓰이는 (GRCh38, mm10같은..)reference는 다운받아서 바로 사용할 수 있게 미리 만들어 제공하고 있다.1 다른 종이나 제공하지 않는 버전의 reference를 사용해서 분석하고 싶다면 custom reference를 만들어서 cellranger pipeline에 먹이면 되는데, referenc...
Dual Index vs. Single Index 현재 Chromium에는 3가지 버전의 solution을 팔고 있다. Gene Expression v3.1-Dual Index Gene Expression v3.1-Single Index Gene Expression v3 Dual index가 가장 최근 버전이며, 세 가지 버전 모두 ...