졸업 논문을 쓰면서 논문을 쓰는 방식을 정말 많이 찾아봤는데, 생각해보니 지금까지 논문을 쓰면서 어떻게 하면 논문을 잘 쓰는지 논문을 쓰는 방법에 대한 내용을 공부해본 적이 없다는 사실을 깨달았다!! 그래서 찾아보니 학교 도서관에서 논문작성법에 관한 특강을 진행한다고 하여 바로 신청하고 들어봤다. 원병문 교수님의 방법을 사용하면, 모든...

이 후기를 이렇게 빨리 쓰게 될 줄 몰랐는데, 진짜 세상 좋아졌고, 우리는 완벽한 지구촌 시대에 살고 있다. 아직도 '지구촌'이라는 단어를 쓰는지 모르겠지만;; 미국에 가 있는 남자친구한테 선물을 보내주기 위해 시간이 날때 장을 봤다. ENTP는 아무 생각없이 사고 싶은 것을 샀지만.. 해외배송 택배에는 제약도 많고 알아봐야 할 것도 많았다....

스펙 키 갯수 : 68키 프레임 재질 : 플라스틱 보강판 : 철 하부 흡음재 : 실리콘 기보강 차음재 : 실리콘 스위치 타입 : 게이트론 프로 LED : RGB 키보드 인터페이스 : 유선, 무선 2.4Ghz 블루투스 블루투스 버전 : 5.2 OS 지원 : Windows / Android / Mac / IOS ...

published online: 28 March 2022 Nature Biomedical Engineering, 2022, 6, pages 435–448 doi: 10.1038/s41551-022-00868-4 Introduction The spinal cord is a part of the central nervous system...

내년에 졸업하고 미국으로 유학을 갈 생각을 하니, 영어 회화가 걱정되기 시작했다. 후후 나는 솔직히 이야기해서 중학교때 이후로 제대로된 영어교육을 받은적이 없다. 그때 배우고 아직까지 써먹는것도 어떤 의미로 대단쓰..ㅋㅋㅋㅋ 영어로 읽고 쓰기, 듣기 그래도 어느정도 자신있는데 (메일쓰기, 논문 읽/쓰기, 세미나 듣기 쌉가능) 외국인과 디스커션 ...

ChimerDB 4.0 https://www.kobic.re.kr/chimerdb/ published online: 4 November 2019 Nucleic Acids Research, 2020, Vol. 48, Database issue D817–D824 doi: 10.1093/nar/gkz1013 Abstract Fusi...

Stacked bar plot single cell data분석 결과를 표현하는 가장 기본이 되는 그림중 하나가 아닐까 싶다. UMAP으로 visualization하고 cell type annotation 마친뒤, type별 proportion을 보여주게 되는데, stacked bar 로 많이 표현하는거 같다. ggplot 사용해서 그려봄. 나중...

샘플별로, cell 별로 몇개의 유전자가 발현하고 어느정도의 발현량을 갖는지 확인하기 위한 코드를 짜봤다. bulkRNAseq data를 다루던 버릇이 남아서 그럴수도… cellranger results에서 web-summary.html을 열어보면 mean expressed gene count가 나오긴 한다. 그래도 좀 더 자세히 알아보고 싶어서....

cell type annotation label Seurat으로 clustering 한뒤에, canonical cell type marker나 reference data 와의 비교를 통해 cell type annotation을 하고 확정된 cell type을 metadata로 저장하기 위한 코드 일반적으로 cluster 별로 annotation 할...

Normaliztion이 필요한 이유 및 최신 툴 seurat normalizaion 과정 찾아보다가 보게 된 글. 정리용 Single cell RNA sequencing(scRNA-seq)의 목적은 대부분 sub-population을 찾고, DEG(Differential Gene Expression Analysis)분석 하는데에 있다. Curse...