cell type annotation은 single-cell data분석에 있어서 가장 기본이 되는 분석 중에 하나지만 아직까지도 그 방법이 정형화되어 있지 않다. 초기에 가장 많이 사용했던 방법은 known marker gene expression을 확인하는 것이었는데, 말 그대로 어떤 cluster에서 알고 있는 cell type의 marker ...

박사 졸업 그 이후의 이야기 ...

Sample 별로 해당하는 Cell ID에 label 달기!! Related post How to label cluster in seurat clustering 마치고 cluster별로 cell type annotation하는 법 소개 이전 포스트랑 비슷하지만 다르게 이번에는 처음 데이터 가져와서 QC도 하기 전에 Cell마다 samp...

인터뷰 이후 좋은 결과가 있어서 offer를 받았다면, 이제 진짜 시작이다. 이후 과정은 다음과 같이 진행됐다. flowchart TB id1([Oral offer]) --1week--> id2([Mount sinai 정식 hiring page 통해서 지원하라고 요청]) --> id3([Application 접수]) --after...

인터뷰요청이 오면 대부분 답장이 온 그 주 중에 하루를 잡아 인터뷰하자고 요청이 온다. 시차를 고려했을때, 미국 동부기준 한국 늦은 밤(11시~12시) = 미국 아침 (9시~10시) 한국 새벽 (4~5시) = 미국 점심 (오후 2시~3시) 보통의 랩미팅 시간 한국 아침 (8시) = 미국 저녁 (오후 6시) 이정도 옵션이 있다. 눈치보지말고 자...

Celltype Annotation Single-cell data분석에서 가장 먼저 & 기본적으로 진행하는 분석. 첫번째로 시도 하는 방법 있을법한 cell type들의 known marker gene expression을 확인해본다. Feature Plot 예쁘게 그리는 법 ⛔단점 내 생각대로 안나올 가능성 높음. ...

Tunnel Bear 설치 및 사용법 남자친구가 블랙프라이데이를 맞아 새로운 핸드폰을 장만했다. '누나가 핸드폰은 못사주지만! 핸드폰 케이스를 선물해 줄게!!' 하고 케이스티파이에서 예전부터 눈여겨 보고 있던 케이스를 선물 하려고 했는데... :airplane: 전세계 무료 배송이라며?!?! 결제하려고 보니까 주소가.. 한국밖에 선택이 ...

관심있는 랩을 찾았다면 교수한테 직접 메일을 보내서 포스닥 자리가 있는지 나랑 함께 일할생각이 있는지 물어봐야한다. 준비물 Cover letter CV Research Statement cover letter는 1장짜리 날 소개하는 편지인데 난 대부분 메일 내용에 적어넣었다. CV는 연구실적 및 능력, 성과를 요약 정리한 이력서, ...

입원부터 퇴원까지 입원하는 날부터 수술당일, 그 다음날 아침 재시술, 그리고 퇴원까지 + 정산 내역 포함 (시술 & 입원 비용) TL;DR link 입원전 코로나 검사 입원 당일 수술-첫째날 수술-둘째날 수술 후기 & 고통 정도 수술비 정산 느낀점 💜 입원 D-2 (2022 Oct 01) 아산병원...

졸업했고, 해외로 포스닥을 나갈 생각이 있다면 이제 어떤 연구실에서 포스닥을 시작할지 찾아봐야지! 생각보다 길고 긴 여정이 될 수 있으니 마음의 준비를 단단히 하는 것이 좋다. (아닐수도) 난 논문이 많지 않아서 더 고생한걸 수도 😂 이 방법은 그냥 내가 쓴 방법을 정리한거지 프로토콜이 절대 아니니 참고만 하고 뭐든 마음가는대로 선택하길! 우선순위...