이미 SRA에 raw fastq file은 업로드 마친 상황. GEO accession number받기 위해 processed file 도 준비해봄. 보통 Bulk RNA-seq의 경우, raw_count.txt matrix / single-cellRNA-seq의 경우 cellranger 결과물 (barcodes, features, matrix 세개...

매번 다시 찾아보고 하는게 귀찮아서 이게 마지막이다 생각하고 정리함. 준비물 👉 SRA toolkit NCBI EDirect(Entrez Direct) (optional) Run 리스트를 뽑고 prefetch로 .sra를 먼저 받기(= resumable) 로컬 .sra를 fasterq-dump로 FASTQ 변환 # Ste...

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상황 👇 자세한 내용 참고 포스트 2025 green card 승인 타임라인

TL;DR timeline 24년 10월 25일 : EB1 I140 급행 패키지 발송. 24년 10월 28일 : EB1 I140 접수 확인 (PD) 24년 11월 7일 : EB1 I140 승인 25년 2월 24일 : EB1 I485 패키지 발송 25년 3월 13일 : EB1 I485 접수 확인 25년 3월 17일 : Photo...

상황 J1 + J1 부부 (남편 22년 시작, 본인 23년 시작) 변호사 상담후 남편이름으로 신청. 난 dependent (본인은 patent 없음 이슈, 누구이름으로 하던 NIW는 실패시 추가금없이 될때까지 해주는 조건가능 & EB1A는 70% 가능성 이야기하심, 당시 본인기준 논문 3개 110 citataion record) ...

ImportError 보통 python import했는데 에러나면 모듈 설치가 안돼서 그런거니 pip uninstall [module] pip install [module] # OR conda install --force-reinstall [module] 하면 보통 해결됨. conda 사용시 다른 python 경로 사용에 따른 에러 위처...

What is a cover letter? 내 경험, qulification, role에 대한 good interviewer 인걸 enthustiastic하다는거 보여줘야함. 요구하지 않아도 넣어라 1장 이내 straightforward simple Header contact info Salutation linkedIn에서 누가 찾고 있다...

convert_human_to_mouse <- function(gene_list) { output = c() mouse_human_genes = read.csv("https://www.informatics.jax.org/downloads/reports/HOM_MouseHumanSequence.rpt",sep="\t") for...

이 글은 seurat version 5를 기준으로 작성되었습니다. single-cell CITE-seq data처리하는데 ADT gene은 뒤에 ‘-TotalSeqC’ 이 붙어 있어서 그림 그릴때마다 이거 지우느라고 한줄씩 더 쓰는게 킹받아서 아예 없애버리는 길을 선택함 layer가 여러개라 안에 데이터 들어있으면 다 바꿔주는게 좋음 ro...