[QC] Scrublet: doublet 제거법 02

지난번 포스팅에서는 DoubletFinder로 Doublet찾는 방법을 알아봤는데..

Doublet이 뭔지, DoubletFinder 사용법

👉 [QC] DoubletFinder: doublet 제거법 01 포스트 참조

이번에는 비슷하지만 다른툴,Scrublet,로 똑같이 Doublet을 찾아보고 DoubletFinder결과랑 비교해보자.

미리 이야기 하자면, 둘의 한가지 차이는 언어다. Scrublet은 python base tool이다. DoubletFinder는 R package. Scrublet사용하려면 R과 python을 넘나 들어야함.

Scrublet

🔗github page
🔗publication link / Published: April 24, 2019 / DOI: https://doi.org/10.1016/j.cels.2018.11.005

DoubletFinder는 2019 April 03에 published인데, 20일쯤 뒤에 또다른 툴 나오는건 비교해달라고 소리지르는거 아니냐. Author들도 내면서 쫄깃쫄깃했겠다. 심지어 같은 저널임ㅋㅋㅋ 그때 테마가 Doublet이었나봄

Mechanism & Processing step

Scrublet의 작동방식은 다음과 같다.