Archives
- 25 Sep [미국적응기] 미국에서 한국 심카드 esim으로 변경하기
- 13 Sep [미국적응기] 미국살이 필수앱 추천 및 레퍼럴코드
- 11 Sep Seurat object 만든 이후 Gene filtering 하기
- 11 Sep [Seurat] SCTransform getGlobalsAndPackages error 해결방법
- 03 Sep bash 파일 사이즈 체크 하는법
- 01 Sep tar.gz 압축 해제 command
- 01 Sep [Photoshop] 물체 주위로 텍스트 / 이미지따라 텍스트 넣기
- 01 Sep [Photoshop] 사진 여러개 하나로 이어붙이기/합치기
- 30 Aug [미국적응기] USPS 우편 보내기 / Priority stamp vs. Forever stamp, First class stamp
- 29 Aug [미국적응기] 우체국에서 Money order 구입방법 / 작성방법
- 28 Aug [미국정착기] J1 waiver 웨이버(귀국의무면제) DS-3035 작성법 / Statement of Reason 예시
- 24 Aug [미국정착기] J1 waiver 웨이버(귀국의무면제) 신청 방법 / 타임라인 2024ver. / 뉴욕총영사관 &필리출장소
- 13 Aug SuperCell-MEGENA: Optimal G value 찾기
- 07 Aug SuperCell-MEGENA pipeline
- 05 Aug libtiff installation from source code without sudo permission
- 30 Jul Violin Plot P-value 포함
- 12 Jul 서버에서 구글 드라이브 파일 다운받기
- 02 Jun SingleCell RNA-seq data로 GSEA하는법
- 01 Jun LINCS DB, perturbation data, 데이터 다운로드 및 R로 불러오기
- 31 May SPOTlight: Deconvolution of VISIUM data from singlecell reference
- 31 May SPOTlight: Deconvolution of VISIUM data from singlecell reference
- 18 May 깃블로그 구글서치콘솔 등록하기
- 15 May Github Desktop 설치 및 기본 사용법/ 코드 없이 GUI로 깃헙 편하게 사용하기
- 10 May 깃블로그 시작하기: 처음 시작부터 기본커스터마이징 w/ chirpy 테마
- 06 May MEGENA 튜토리얼: 설치부터 기본 사용, visualization까지
- 28 Apr 구글 서치 콘솔 인데스 왜 안만들어질까 / 여러실험
- 26 Apr 에드센스 ads.txt 찾을수 없음 해결하기
- 25 Apr LINCS DB, perturbation data, 데이터 다운로드 및 R로 불러오기
- 12 Apr [10X CellRanger] Multi pipeline, GEX/TCR/BCR/SP 한번에 처리하는법
- 07 Apr 에드센스 통과! 짐작하는 안됐던 이유
- 06 Apr [QC] DoubletFinder: 2024 업데이트 버전
- 02 Apr R에서 umap-learn 사용하기 / 분명 설치했는데 없다고 나올때 해결법
- 30 Mar Giotto: comprehensive toolbox for spatial data analysis
- 24 Mar VISIUM data from Seurat to Giotto
- 23 Mar SRA에서 single cell 데이터 다운 받기
- 18 Mar [미국적응기] IRS 세금 보고 J1 포스닥 2년짜리 DS-2019로 tax treaty받기/sprintax 오류해결법, 그린카드 되면 세금 토해내야하나
- 03 Mar GDAL, GEOS, PROJ installation from source code without sudo permission
- 02 Feb Visual Studio 서버 접속 에러 해결방법
- 28 Jan Protein-protein interaction network에서 shortest path distance 구하기
- 24 Jan [미국적응기] 필리에서 marriage certificate받기
- 22 Jan CellPhoneDB: Cell-Cell interaction analysis
- 21 Jan R: Gene name list에서 Mitochondrial, Ribosomal gene 제거하기
- 16 Jan Seurat DEG로 MA plot 그리기
- 13 Jan Seurat DEG로 VolcanoPlot그리기: 간단버전
- 12 Jan SuperCell: sparsity 극복 시리즈 02
- 07 Jan SingleCell RNA-seq data로 GSEA하는법
- 06 Jan Cell type proportion을 비교하는 방법: Odd Ratio
- 31 Dec project env. setup 저장용 포스트
- 26 Dec [미국적응기] 뉴욕 지하철 공짜로 타는 카드: Future Debit Card
- 21 Dec [미국적응기] HealthEquity / WageWorks Transit (Commuter card) & TRIP 한정 MTA 무제한 이용권 구입후기
- 20 Dec Becoming a Peer Reviewer
- 18 Dec R 시간 재기: tic(), toc()
- 16 Dec MetaCell R version: sparsity 극복법 01, pseudobulk 만들기
- 14 Dec [미국적응기] 뉴욕 지하철 카드 OMNY, 일주일에 12번 타면 나머지는 공짜
- 10 Dec Seurat 4 error 대처법: 초심으로 돌아가 지우고 다시 깔아라
- 07 Dec 🗝️🗝️ Conda Env setup code
- 22 Nov 구글 드라이브 CDN으로 사용해서 블로그 사진 업로드하는 법
- 21 Nov [미국적응기] 안과 방문부터 콘텍트렌즈 구입
- 12 Nov scRepertoire: TCR/BCR seq 분석하는 R package
- 11 Nov MuSiC: BulkRNA Deconvolution tool using scRNA-seq data
- 04 Nov CIBERSORTx:
- 01 Nov R function 수정하기 body(), reshape::melt 함수 에러 해결법
- 28 Oct Monocle3
- 11 Oct Python3 install from source code
- 07 Oct 오랄비io 시리즈 배터리 교체 후기
- 06 Oct [QC] Scrublet: doublet 제거법 02
- 01 Oct [필리 맛집] Frozen: 차이나타운 철판아이스크림
- 29 Sep [미국 적응기] 대한항공 스카이패스 비자 카드 발급후기
- 28 Sep [뉴욕 탈출기] 뉴욕에서 필라델피아로 이사하기: piece of cake 후기
- 27 Sep jupyter notebook: conda로 설치하기
- 21 Sep CMake install from source code
- 17 Sep Seurat version5 다른 포맷으로 변환 SingleCellExperiment, loom, h5ad
- 16 Sep GCC install from source code
- 15 Sep [R Error 해결법] install_github() 했을때 Error: Failed to install 'unknown package' from GitHub
- 09 Sep [10x/Seurat] 여러 종 섞어만든 scRNA-seq 데이터에서 종별 cell 구분하는 법
- 07 Sep [필리 적응기] 한국 운전면허 필라델피아 운전면허증으로 바꾸기
- 03 Sep SCENIC with R
- 03 Sep SCENIC
- 30 Aug R source file로 설치 in linux
- 10 Aug Markdown에 google map 넣는 방법
- 01 Aug [필리 맛집] Harp&Crown: 로컬/데이트/퓨전음식/펍/분위기/근사한저녁/필수코스
- 16 Jul Dead Cell Removal Kit
- 15 Jul [QC] DoubletFinder: doublet 제거법 01
- 14 Jul Cell type proportion 변화를 표현하는 방법
- 14 Jul Cell type proportion을 표현하는 방법 02
- 11 Jul [Seurat] DoHeatmap() Error 해결법
- 05 Jul Mac에 🍺 Brew 설치하기 (+ rudy 설치 포함)
- 29 Jun [Ringle] Resume 작성법
- 21 Jun [Seurat] 필요없는 metadata 삭제
- 18 Jun bulkRNA-seq merged fastq file, R1, R1 로 각각 쪼개기
- 02 Jun r memory error 해결방법 in linux
- 24 May [10X CellRanger] Demultiplexing with barcode sequence: bcl2fastq
- 22 May Installation of bcl2fastq from source code
- 21 May [10X CellRanger] Custom Reference Genome: Multi Species
- 18 May bulkRNA-seq preprocessing: STAR-RSEM pipeline
- 09 May zsh 정규표현식 (bash랑 다른점, * 쓰는법)
- 05 May A multi-use deep learning method for CITE-seq and single-cell RNA-seq data integration with cell surface protein prediction and imputation
- 16 Apr 포스닥 준비: 집 계약 - 외환수표 만들기 Money order / Bank check / Bank draft
- 13 Apr [뉴욕 적응기] ConEdison account 만들기: upper east side 1.5BR 집의 전기/가스세는?!
- 05 Apr R 문자열 특정문자 기준으로 자르기
- 04 Apr R memory 관리: limit 확인하고 maximum 재설정하기
- 03 Apr [일잘러의 꿀팁] Mac에서 Alias 설정하기 / 단축어 설정, 컴 껐다켜도 재설정하지 않는 방법
- 02 Apr [Bash] file 한줄씩 읽어들이기
- 31 Mar [일잘러의 꿀팁] Mac Finder에 서버 파일 시스템 연동하기
- 28 Mar Feature Plot Title font size 조절하기
- 26 Mar [깃블로그] Google search console 페이지 색인생성 안됨
- 24 Mar [깃블로그] 처음 블로그 푸시하고 Build 안될때 해결방법
- 23 Mar [뉴욕 생존기: 쿡북] 🍽️ 카레만들기
- 19 Mar [뉴욕 적응기] Mint mobile 미국의 알뜰폰 / $15 bonus code
- 14 Mar [일잘러의 꿀팁] 메일 아래 서명 지정하기 gmail & outlook
- 12 Mar [뉴욕 적응기] Chase가서 은행계좌 만들기 / $200달러 보너스 쿠폰 포함
- 09 Mar .egg 알집 설치 없이 압축풀기
- 03 Feb 포스닥 준비: 집구하기
- 25 Jan 8TB 이상 HDD mount하는법
- 22 Jan 포스닥 준비: 짐싸기 + 한달 살아보고 필요한것 / 필요 없는것 업데이트
- 31 Dec Seurat Dimplot()에서 특정 cell type만 highlight하는 법
- 27 Dec [Notion] 디데이 위젯 넣기
- 21 Dec [Notion] DB column으로 정렬하기
- 20 Dec Chrome 브라우저 전체 캡쳐
- 15 Dec ChatGPT: AI시대의 시작?!
- 14 Dec Jekyll Error 해결 방법
- 10 Dec 포스닥 준비: 고양이 데리고 출국하기
- 08 Dec 포스닥 준비: 국제운전면허증 발급
- 07 Dec R table 내보내기
- 07 Dec Seagate HDD 인식안됨 >> 고장 판정 >> 수리까지
- 02 Dec Cell type 찾기 시리즈 : SingleR
- 02 Dec 🤞미국 포스닥 구하기: 지원부터 출국까지
- 01 Dec Sampling labeling
- 01 Dec Step06: offer 받은 이후 DS2019받기
- 01 Dec Step05: 해외 포스닥 인터뷰
- 29 Nov Cell type 찾기 시리즈 : Human Cell Landscape
- 27 Nov Castify 한국에서 주문하고 미국으로 배송시키기
- 01 Nov Step04: 지원 메일 보내기
- 05 Oct 아산병원 자궁내막종 경화술 수술 후기
- 01 Oct Step03: 해외 포스닥 자리 찾아보기
- 27 Sep SGE 접속 에러 (로그인 안됨)
- 01 Sep Step02: CV 작성법
- 01 Sep Step1: Cover letter 작성법
- 22 Jul 논문 쓰는 방법: 원병묵 교수님 세미나
- 16 Mar 미국으로 택배보내기: 온무빙후기
- 06 Feb Melgeek MOJO 68 구매후기
- 01 Feb Production of human spinal-cord organoids recapitulating neural-tube morphogenesis
- 29 Jan 스픽 vs. 리얼클래스: 영어회화 어떤 어플로 공부할까?
- 01 Jan ChimerDB: The comprehensive database of fusion genes
- 14 Dec Cell type proportion을 표현하는 방법
- 25 Nov Expressed gene count / cell plot
- 25 Nov How to label cluster in seurat
- 25 Nov Normalizing single cell RNA-seq data
- 17 Nov Markdown cheat sheet
- 16 Oct Nature Biomedical engineering 논문 나가기까지의 기록
- 15 Oct SRA meta data parsing
- 07 Oct 3D UMAP plot
- 23 Aug PBS server system
- 28 Jul SRA: sequence read archive
- 07 Jun SRA toolkit
- 25 May inferCNV
- 25 Apr How to draw perfect feature plot with ggplot2
- 22 Mar RNAvelocyto
- 22 Mar RNAvelocyto ver.2
- 22 Mar paper template
- 22 Mar Samtools 설치하는 법 (BCFtools & htslib)
- 22 Mar Anaconda: 인생이 편해지는 방법
- 19 Mar single nuclei RNA-seq analysis: The major advantages and differences
- 08 Mar 공개 데이터 다운받아서 재분석 하는 방법
- 15 Feb Single-cell RNA-sequencing Analysis
- 24 Jan [10X CellRanger] 커스텀 레퍼런스 만들기
- 24 Jan Chromium Single Cell Gene Expression Version 별 차이